Bioinformática
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Quantificar leituras mapeando para vários locais
asked 2017-05-30 14:05:01 UTC
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Existe algum conjunto de dados multi-omics publicamente disponível?
asked 2017-05-30 17:29:00 UTC
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Remapeando as coordenadas genômicas para contabilizar os indels
asked 2017-05-30 19:35:08 UTC
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Têm motivos de DNA de 6-12 bp de comprimento, tentando obter pontuações de conservação
asked 2017-05-31 02:18:08 UTC
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É possível executar o sequenciamento MinION offline?
asked 2017-05-31 11:22:09 UTC
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Como posso melhorar o rendimento das execuções de sequenciamento MinION?
asked 2017-05-31 14:48:19 UTC
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Como posso detectar sistematicamente sequências de código de barras / adaptador desconhecido em um conjunto de amostras?
asked 2017-05-31 14:49:30 UTC
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Quais ferramentas podem detectar RNA quimérico (genes de fusão) a partir de dados WGS ou RNA-Seq?
asked 2017-05-31 15:05:01 UTC
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Como transferir anotações gff no genoma com extensas duplicações?
asked 2017-05-31 16:01:10 UTC
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Trabalhar com construções de genoma antigas
asked 2017-06-01 01:47:18 UTC
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Há algum ponto na recalibração de pontuações para chamadas de variantes?
asked 2017-06-01 03:33:00 UTC
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Baixando um genoma de referência para Bowtie2
asked 2017-06-01 03:56:27 UTC
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URLs de download estáveis
asked 2017-06-01 04:40:03 UTC
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Imputando genótipos ausentes de painéis de genotipagem separados
asked 2017-06-01 12:27:26 UTC
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Existem alternativas RepBase para anotações de elementos de repetição em todo o genoma?
asked 2017-06-01 16:11:10 UTC
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Qual é a diferença entre as versões de especificações VCF 4.1 e 4.2?
asked 2017-06-01 16:15:56 UTC
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Como selecionar estruturas de alta qualidade do Protein Data Bank?
asked 2017-06-01 18:04:41 UTC
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Estimativa de pureza / contaminação / mistura do tumor
asked 2017-06-01 18:08:20 UTC
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Usando shells diferentes de bash
asked 2017-06-01 20:29:48 UTC
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Como exatamente o "comprimento efetivo" é usado no FPKM é calculado?
asked 2017-06-02 00:49:22 UTC
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Genes ausentes e normalização da saída RSEM usando EBSeq
asked 2017-06-02 03:57:13 UTC
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Encontrar a localização e o comprimento da unidade de sequências repetitivas em uma longa leitura
asked 2017-06-02 07:48:05 UTC
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Solucionadores de HMM genéricos em bioinformática?
asked 2017-06-02 12:13:13 UTC
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Existem bancos de dados de modelos para formatos de arquivo de bioinformática comuns?
asked 2017-06-02 19:08:50 UTC
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validar subpopulações de células identificadas em scRNA-seq
asked 2017-06-03 00:22:35 UTC
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Quais são todos os arquivos de referência produzidos pelo índice bwa e eles dependem de a referência ser compactada?
asked 2017-06-03 00:36:08 UTC
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Por que os arquivos BAM criados por ferramentas diferentes têm tamanhos de arquivo diferentes?
asked 2017-06-03 04:38:14 UTC
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Como posso reduzir a resolução de um arquivo BAM, mantendo ambas as leituras em pares?
asked 2017-06-03 04:44:45 UTC
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Qual é a diferença entre samtools, bamtools, picard, sambamba e biobambam?
asked 2017-06-03 04:50:11 UTC
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Por que a maioria dos alinhadores não produz a operação CIGAR "X"?
asked 2017-06-03 04:58:11 UTC
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Mesclar dados de sequenciamento para experimentos ChIP-seq
asked 2017-06-03 17:42:58 UTC
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Por que o bwa-mem é o algoritmo padrão ao usar o bwa?
asked 2017-06-03 18:58:27 UTC
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Qual é a diferença entre NGS, 2GS, SBS e HTS?
asked 2017-06-04 01:57:33 UTC
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Qual é a diferença entre a qualidade do mapeamento SAM e o valor Blast E?
asked 2017-06-04 04:01:34 UTC
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A faísca é amplamente utilizada em bioinformática?
asked 2017-06-04 04:10:33 UTC
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Detectando variantes estruturais com dados MinION
asked 2017-06-04 18:21:05 UTC
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Quais métodos existem para calcular a similaridade do perfil de expressão de RNA
asked 2017-06-04 18:50:24 UTC
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Como posso acelerar a chamada / correção de INDEL em arquivos BAM?
asked 2017-06-05 04:25:12 UTC
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Como faço para subconjunto com eficiência um arquivo muito grande baseado em linha?
asked 2017-06-05 17:49:25 UTC
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Pacotes R para análises de dados de telas CRISPR agrupadas
asked 2017-06-05 21:36:55 UTC
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Quando contabilizar as regiões genômicas da lista negra nas análises de dados ChIP-seq?
asked 2017-06-05 22:15:40 UTC
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Como comparar grupos usando dados WGS?
asked 2017-06-05 23:06:35 UTC
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Como faço um teste de ancestralidade / mistura em um único arquivo VCF?
asked 2017-06-06 17:44:58 UTC
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Converter nomes de genes de um formato de banco de dados público para outro
asked 2017-06-06 18:38:20 UTC
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Como as opções snakemake --cluster e --drama são implementadas?
asked 2017-06-06 19:30:00 UTC
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Quais são algumas boas práticas a serem seguidas durante a análise de dados de metilação do DNA EPIC?
asked 2017-06-07 01:58:15 UTC
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Obtenção de leituras mapeadas exclusivamente do alinhamento mem BWA
asked 2017-06-07 03:23:31 UTC
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Estado da arte na previsão de locais de iniciação da tradução
asked 2017-06-07 04:44:21 UTC
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Qual é a escala para metagênios HOMER?
asked 2017-06-07 08:39:26 UTC
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Construindo Índice do Genoma STAR para sequenciamento de RNA nanopore
asked 2017-06-07 09:20:05 UTC
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