Bioinformática
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Como fazer uma distinção entre o gráfico "clássico" de Bruijn e aquele descrito nos artigos da NGS?
asked 2017-05-19 15:32:45 UTC
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A fgsea e a Broad Institute GSEA são equivalentes?
asked 2017-05-19 17:32:54 UTC
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Compreender o design, contraste e resultados do DESeq2
asked 2017-05-19 19:40:14 UTC
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Por que alguns montadores requerem um kmer de comprimento ímpar para a construção de gráficos de de Bruijn?
asked 2017-05-19 23:34:21 UTC
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As bases de soft-clip são usadas para chamadas de variantes em samtools + bcftools?
asked 2017-05-19 23:50:05 UTC
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Phyre2 vs ITasser, modelos completamente diferentes gerados
asked 2017-05-19 23:59:49 UTC
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Como os algoritmos de pico estreito e de pico amplo do MACS2 são diferentes?
asked 2017-05-20 05:21:09 UTC
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Dado um VCF de um genoma humano, como avalio a qualidade em relação aos SNVs conhecidos?
asked 2017-05-21 02:49:51 UTC
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Como lidar com a heterozigosidade durante o polimento da montagem do genoma com base em leituras longas?
asked 2017-05-21 16:49:59 UTC
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Distribuição de frequência alélica esperada de SNVs em dados NGS reais
asked 2017-05-22 15:47:44 UTC
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O estado, limitações e comparações de grandes lojas de variantes
asked 2017-05-22 21:14:17 UTC
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Projetando um esquema de banco de dados de arquivo NGS de laboratório
asked 2017-05-22 21:32:41 UTC
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Ferramentas para simular leituras Oxford Nanopore
asked 2017-05-22 23:19:53 UTC
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Letras maiúsculas e minúsculas no genoma de referência
asked 2017-05-24 08:26:50 UTC
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Os efeitos da conversão de bissulfito incompleta sobre a eficiência do mapeamento
asked 2017-05-24 11:41:10 UTC
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Quais são as vantagens e desvantagens entre o uso de KEGG ou Reactome?
asked 2017-05-24 12:35:31 UTC
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Classificação de amostras com base na expressão do gene marcador
asked 2017-05-24 20:41:28 UTC
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Como posso melhorar um assembly de leitura longa com um genoma repetitivo?
asked 2017-05-25 16:46:36 UTC
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Qual é a diferença entre os tipos de células ENCODE Tier 1, 2 e 3?
asked 2017-05-25 23:21:50 UTC
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variante chamando dados de estilo ChIP-seq: samtools mpileup com filtros mínimos
asked 2017-05-26 18:23:01 UTC
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Como selecionar as vias mais representativas de uma análise de enriquecimento de genes?
asked 2017-05-26 19:07:00 UTC
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Existe uma maneira fácil de criar um resumo de um arquivo VCF (v4.1) com variações estruturais?
asked 2017-05-29 02:40:14 UTC
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Como ler a variante estrutural do VCF?
asked 2017-05-29 11:25:31 UTC
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Como pode a contribuição da linha celular ser estimada a partir dos dados RNASeq?
asked 2017-05-30 12:30:54 UTC
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Quantificar leituras mapeando para vários locais
asked 2017-05-30 14:05:01 UTC
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Existe algum conjunto de dados multi-omics publicamente disponível?
asked 2017-05-30 17:29:00 UTC
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Remapeando as coordenadas genômicas para contabilizar os indels
asked 2017-05-30 19:35:08 UTC
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Têm motivos de DNA de 6-12 bp de comprimento, tentando obter pontuações de conservação
asked 2017-05-31 02:18:08 UTC
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É possível executar o sequenciamento MinION offline?
asked 2017-05-31 11:22:09 UTC
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Como posso melhorar o rendimento das execuções de sequenciamento MinION?
asked 2017-05-31 14:48:19 UTC
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Como posso detectar sistematicamente sequências de código de barras / adaptador desconhecido em um conjunto de amostras?
asked 2017-05-31 14:49:30 UTC
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Quais ferramentas podem detectar RNA quimérico (genes de fusão) a partir de dados WGS ou RNA-Seq?
asked 2017-05-31 15:05:01 UTC
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Como transferir anotações gff no genoma com extensas duplicações?
asked 2017-05-31 16:01:10 UTC
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Trabalhar com construções de genoma antigas
asked 2017-06-01 01:47:18 UTC
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Há algum ponto na recalibração de pontuações para chamadas de variantes?
asked 2017-06-01 03:33:00 UTC
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Baixando um genoma de referência para Bowtie2
asked 2017-06-01 03:56:27 UTC
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URLs de download estáveis
asked 2017-06-01 04:40:03 UTC
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Imputando genótipos ausentes de painéis de genotipagem separados
asked 2017-06-01 12:27:26 UTC
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Existem alternativas RepBase para anotações de elementos de repetição em todo o genoma?
asked 2017-06-01 16:11:10 UTC
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Qual é a diferença entre as versões de especificações VCF 4.1 e 4.2?
asked 2017-06-01 16:15:56 UTC
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Como selecionar estruturas de alta qualidade do Protein Data Bank?
asked 2017-06-01 18:04:41 UTC
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Estimativa de pureza / contaminação / mistura do tumor
asked 2017-06-01 18:08:20 UTC
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Usando shells diferentes de bash
asked 2017-06-01 20:29:48 UTC
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Como exatamente o "comprimento efetivo" é usado no FPKM é calculado?
asked 2017-06-02 00:49:22 UTC
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Genes ausentes e normalização da saída RSEM usando EBSeq
asked 2017-06-02 03:57:13 UTC
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Encontrar a localização e o comprimento da unidade de sequências repetitivas em uma longa leitura
asked 2017-06-02 07:48:05 UTC
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Solucionadores de HMM genéricos em bioinformática?
asked 2017-06-02 12:13:13 UTC
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Existem bancos de dados de modelos para formatos de arquivo de bioinformática comuns?
asked 2017-06-02 19:08:50 UTC
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validar subpopulações de células identificadas em scRNA-seq
asked 2017-06-03 00:22:35 UTC
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Quais são todos os arquivos de referência produzidos pelo índice bwa e eles dependem de a referência ser compactada?
asked 2017-06-03 00:36:08 UTC
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